何のことを言っているかというと、この前Google Chromeをメインのブラウザに移行したのですが、時々グリモン（Greasemonkey）が動いてくれないことがありました。
原因は非常に単純。
Google Chromeの起動の順番が悪かったという事です。
自分の場合はGoogle Chromeの見ているサイトをアプリケーション化する機能で、色々ショートカットを作っています。
TwitterやGoogle Tasksです。
Google Chromeでグリモンを利用する場合は、ショートカットに--enable-user-scripts というオプションを付ける必要があります。
お分かりの通り、一番最初にオプションを付けたGoogle Chromeを立ち上げれば問題ないのですが、オプションを付けていないアプリケーションのショートカットを先に起動した場合はグリモンが有効になりません。
起動の順番に気を使わないといけない訳です。
それが面倒ならアプリケーションのショートカットにも--enable-user-scripts を指定してやれば問題なしです。